干細胞實(shí)驗室應至少能夠執行六項任務(wù)：無(wú)菌處理、孵化、制備、清洗、滅菌、存儲。

一.無(wú)菌操作區
（1）無(wú)菌操作區域：無(wú)菌操作區域在干細胞實(shí)驗室中負責細胞培養和其他無(wú)菌操作區域，與外界隔離，不能穿行或受其他干擾。
理想的無(wú)菌操作室應分為三個(gè)部分：
a）更衣室——更換衣服、鞋子，穿戴帽子和面具。

b）緩沖室 -——位于更衣室和手術(shù)室之間，以確保手術(shù)室內的無(wú)菌環(huán)境，并放置恒溫培養箱和一些必要的小器械。

c）無(wú)菌手術(shù)室——于無(wú)菌處理、細胞培養。房間大小應適當，頂部不宜過(guò)高（不超過(guò)2.5m），以確保紫外線(xiàn)的有效殺菌 效果；墻壁光滑，方便清潔和消毒。工作臺不應靠墻放置。臺面要平滑壓塑作表面，涂漆成白色或灰色，以便于觀(guān) 察解剖結構和酚紅。

（2）凈化工作臺：操作簡(jiǎn)單，安裝方便，占用空間小，凈化效果好。在一實(shí)驗室中主要使用的兩種的凈化工作臺：
a）側流或垂直式
b）外流或水平層流式。

二.孵化區
盡管該區域對無(wú)菌的要求并不比無(wú)菌區域嚴格，但它們仍然需要清潔無(wú)塵，因此它們也應放置在干擾少的區域。孵育可以在培養箱中或控制溫度的溫室中進(jìn)行，相比之下溫室是費用較高，通常實(shí)驗室多采用培養箱孵育。

三.制備區
在該區域中，主要進(jìn)行培養液，有關(guān)培養用液等實(shí)驗用品的制備。

四.存儲區域
主要存放各種冰箱、干燥箱、液氮罐、無(wú)菌培養液、培養瓶等，此環(huán)境還需要清潔無(wú)塵。

五.清潔和消毒區域
清潔和消毒區域應與其他區域分開(kāi)，主要用于清潔所有細胞培養容器、準備、消毒及三蒸水制造等。